Страница статьи

Экспресс-идентификация положительных гемокультур с помощью метода прямой MALDI-TOF-масс-спектрометрии


DOI:

Полный текст:


Аннотация

Цель исследования. Оценить эффективность прямой идентификации возбудителей бактериемии с помощью прямой матричной лазерной десорбционной ионизационной времяпролетной (MALDI-TOF) масс-спектрометрии в сравнении с рутинным методом. Материал и методы. В проспективное исследование включено 211 положительных гемокультур, полученных от 116 пациентов (106 взрослых и 10 детей) в возрасте от 2 нед до 77 лет, находящихся в ОРИТ после операций на открытом сердце. Инкубация осуществлялась в аэробных флаконах с сорбентом для антибиотиков с помощью анализатора BacT/ALERT 3D 120 (bioMerieux, Франция). Параллельно с рассевом первичных гемокультур на плотные питательные среды с последующей идентификацией чистых культур с применением MALDI-TOF-масс-спектрометрии на анализаторе Vitek MS, bioMerieux, Франция (рутинный метод), после соответствующей пробоподготовки осуществляли прямое (без предварительного рассева) MALDI-TOF-масс-спектрометрическое исследование монокомпонентных гемокультур (n = 201). Результаты. С применением рутинного метода в 211 положительных гемокультурах идентифицировано 23 вида микроорганизмов (стафилококки (n = 87), энтеробактерии (n = 71), энтерококки (n = 20), неферментирующие грамотрицательные бактерии (n = 18), прочие (n = 5)). Среднее время инкубации образцов до получения сигнала о наличии роста гемокультуры составило 16,2±7,4 ч (от 3,75 до 51 ч). В течение первых 12 ч инкубации получен рост 32,4% проб, а в первые сутки - 92,2%. При прямом масс-спектрометрическом анализе монокомпонентных гемокультур (n = 201) корректно определено до вида 153 (76,1%) образца, при этом доля успешных идентификаций грамотрицательных бактерий была выше, чем грамположительных (85,4 и 69,1% соответственно; p = 0,01). Выявлена высокая степень согласованности результатов стандартного и прямого методов идентификации гемокультур с помощью MALDI-TOF-масс-спектрометрии (κ = 0,96, p < 0,001; в расчет включены образцы, для которых оба варианта дали результат). Случаи неудачной прямой идентификации гемокультур (n = 48) в большинстве (89,6%) были связаны с невозможностью соотнесения полученного при анализе образца масс-спектра с библиотечным (ответ системы - «нет идентификации»). В остальных 5 случаях выявлено расхождение результатов, при этом в трех пробах отмечено несовпадение вида микроорганизма, не имеющее клинического значения (S. haemolyticus (n = 2) и S. hominis (n = 1) по данным масс-спектрометрического анализа и S. epidermidis в посеве), в двух случаях микроорганизм идентифицирован неправильно (Mycobacteriumka nsasii и Burkholderia vietnamensis вместо S. epidermidis и S. hominis соответственно). Среди включенных в исследование образцов было 10 смешанных культур (ассоциации из двух микроорганизмов), которые также были подвергнуты прямому масс-спектрометрическому анализу. При этом в 7 (70%) случаях был определен до вида один микроорганизм из ассоциации, в 2 случаях имела место корректная идентификация одного из микроорганизмов до рода, еще в одной пробе результат не получен. Временные затраты на проведение прямого масс-спектрометрического анализа, включая пробоподготовку, составляли не более 1 ч. Вывод. Метод прямой MALDI-TOF-масс-спектрометрии позволяет значимо ускорить идентификацию гемокультур, что может способствовать максимально раннему назначению эффективных режимов стартовой антибиотикотерапии.


Для цитирования:

For citation:

Обратные ссылки

  • Обратные ссылки не определены


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 3.0 License.

ISSN: (Print)
ISSN: (Online)