ИММУНОГЕНЕТИЧЕСКИЙ ПРОФИЛЬ (HLA-A, HLA-B, HLA-C, HLA-DRB1, HLA-DQB1) ПОПУЛЯЦИИ РУССКИХ ЧЕЛЯБИНСКОЙ ОБЛАСТИ

Проведено иммуногенетическое типирование 591 донора ГБУЗ Челябинская областная станция переливания крови, идентифицирующих себя русскими, по 5 генам HLA-А, HLA-B, HLA-C, HLA-DRB1, HLA-DQB1 на базовом разрешении. Был использован метод полимеразной цепной реакции с сиквенс-специфическими праймерами (SSP-PCR) со стандартными наборами ("Protrans", Германия). С помощью стандартной иммуногенетической программы Арлекин рассчитаны частоты генов (GF), частоты двух- и пятилокусных гаплотипов HLA (HF), величины неравновесного сцепления (D') двухлокусных гаплотипов. Показаны наиболее характерные для русских Челябинской области аллельные семейства генов (А*01,*02,*03; В*07, В*44, В*35; С*03,*04,*07,*12; DRB1*01, DRB1*15, DRB1*13, DRB1*07; DQB1*02,*03,*05,*06) и гаплотипов A*01-B*08-C*07-DRB1*03-DQB1*02 (HF 4,06), A*03-B*07-C*07-DRB1*15-DQB1*06 (HF 3,3), A*03-B*35-C*04-DRB1*01-DQB1*05 (HF 2,88), A*02-B*13-C*06-DRB1*07-DQB1*02 (HF 1,61). Показаны наиболее сцепленные двухлокусные гаплотипы аллельных семейств генов В*-С* и DRB1*-DRQ1*. На основе расчета генетических расстояний (по Нею) по локусам HLA-A, HLA-B, HLA-DRB1, с использованием многомерного шкалирования, представлено расположение 56 популяций, включая данные по популяциям Челябинской области. Полученные закономерности могут быть использованы в практической работе для создания регистра доноров стволовых клеток России. Данные могут быть использованы как контрольная группа для проведения работ «ассоциация HLA с заболеваниями», использованы специалистами по этногенезу народов.

Всероссийская перепись населения 2010 г. Available at: http:// www.gks.ru/free_doc/new_site/perepis2010/croc/perepis_ itogi1612.htm (дата обращения 16.06.2015). [NationalPopulation Census 2010]. (in Russian) Available at: http://www.gks.ru/free_doc/new_site/perepis2010/croc/perepis_ito gi1612.htm (accessed 16.06.2015).

Самигулов Г.Х. Челябинск XVIII-XIX веков: население, планировка, материальная культура (по данным археологии и письменных источников): Автореф. дис.. канд. истор. наук. Ижевск; 2005. [Samigulov G.Kh. Chelyabinsk XVIII-XIX: population, planning, material culture (according to archeology and written sources). Dis. Izhevsk; 2005]. (in Russian)

Елисеева В. Я., Григорьев Б.В., Матушкин П.Г., Тяжельников Е.М., Четин В.Е. Краткий очерк истории Челябинской области. Челябинск: Южно-Уральское кн. изд-во; 1965. [Eliseeva VYa., Grigoriev B.V, Matushkin P.G., Tyazhelnikov E.M., Chetin VE. Short History of the Chelyabinsk Region. Chelyabinsk: Yuzhno-Uralskoe knizhnoe izdatelstvo; 1965]. (in Russian)

Балановская Е.В., Балановский О.П. Русский генофонд на Русской равнине. М.: Луч; 2007. [Balanovskaya E.V., Balanovskiy O.P. Russian gene pool of the Russian Plain. Moscow: Luch; 2007]. (in Russian)

Bubnova L.N., Zaitseva G.A., Erokhina L.V, Berkos A.S., Reutova N.V., Belyaeva E.V., et al. A comparative study of HLA-A and HLA-В antigens and haplotype distribution among donors of hematopoietic stem cells from Russian and German regions. Cell. Ther. Transplant. 2008; 1(1): 28-34.

Хаитов Р.М, Алексеев Л.П., Балановская Е.В., Болдырева М.Н., Балановский О.П., Евсеева И.В. и др. HLA-генетическое разнообразие населения России и СНГ. 1. Русские. Иммунология. 2005; 5: 260-3. [Khaitov R.M, Alekseev L.P., Balanovskaya E.V., Boldyreva M.N., Balanovskiy O.P., Evseeva I.V, et al. HLA-genetic diversity of the population of Russia and CIS. 1. Russkie. Immunologiya. 2005; 5: 260-3]. (in Russian)

Евсеева И.В., Уэлс С., Тонкс С. Генетический полиморфизм генов иммунного ответа класса I в коренных популяциях европейского Севера России. Иммунология. 2001; 5: 27-30. [Evseeva I.V, Uels S., Tonks S. Genetic polymorphism of immune response genes in Class I of indigenous populations of Northern European Russia. Immunologiya. 2001; 5: 27-30]. (in Russian)

Suslova T.A., Burmistrova A.L., Chernova M.S., Khromova E.B., Lupar E.I., Timofeeva S.V, et al. HLA gene and haplotype frequencies in Russians, Bashkirs and Tatars, living in the Chelyabinsk Region (Russian South Urals). Int. J. Immunogenet. 2012; 39(5): 394-408. doi: 10.1111/j.1744-313X.2012.01117.x.

Суслова Т.А., Бурмистрова А.Л., Чернова М.С., Вавилов М.Н., Хромова Е.Б. Распределение генов, гаплотипов HLA в популяции башкир, проживающих в Челябинской области. Иммунология. 2011; 2: 65-9. [Suslova T.A., Burmistrova A.L., Chernova M.S., Vavilov M.N., Khromova E.B. The distribution of genes, HLA haplotypes of Bashkir population living in the Chelyabinsk region. Immunologiya. 2011; 2: 65-9]. (in Russian)

Riccio M.E., Buhler S., Nunes J.M., Vangenot C., Cuenod M., Currat M., et al. 16th IHIW: Analysis of HLA Population Data, with updated results for 1996 to 2012 workshop data (AHPD project report). Int. J. Immunogenet. 2013; 40(1): 21-30.

Gonzalez-Galarza F.F., Takeshita L.Y, Santos E.J., Kempson F., Maia M.H., Silva A.L., et al. Allele frequency net 2015 update: new features for HLA epitopes, KIR and disease and HLA adverse drug reaction associations. Nucl. Acid Res. 2015; 39(28): D784-8.

Allele Frequency Net Database. AFND; Available at: http://www. allelefrequencies.net (accessed 16.06.2015)

Excoffier L., Lischer H.E.L. Arlequin suite ver 3.5: A new series of programs to perform population genetics analyses under Linux and Windows. Mol. Ecol. Res. 2010; 10(3): 564-7.

Чернова М.С. Иммуногенетический профиль популяций Челябинской области (русские, татары, башкиры, нагайбаки) в структуре мировых популяций: Автореф. дис.. канд. би-ол. наук. Челябинск; 2014. [Chernova M.S. Immunogenetic profile populations of Chelyabinsk region (Russian, Tatars, Bashkirs, Nagaybaks) in the structure of the world’s population. Dis. Chelyabinsk; 2014]. (in Russian)

Kruskal J.B. Multimensional scaling by optimizing goodness of fit to a nonmetric hypothesis. Psycometrika. 1964; 9(1): 1-27.

Sanchez-Mazas A., Fernandez-Vina M., Middleton D., Hollenbach J.A., Buhler S., Di D., et al. Immunogenetics as a tool in anthropological studies. Immunology. 2001; 133(2): 143-64.

Darke C., Guttridge M.G., Thompson J., McNamara S., Street J., Thomas M. HLA class I (A,B) and II (DR,DQ) gene and haplotype frequencies in blood donors from Wales. Exp. Clin. Immunogenet. 1998; 15(2): 69-83.

Dunne C., Crowley J., Hagan R., Rooney G., Lawlor E. HLA-A, B, Cw, DRB1, DQB1 and DPB1 alleles and haplotypes in the genetically homogenous Irish population. Int. J. Immunogenet. 2008; 35 (4-5): 295-302.

Schipper R.F., D’Amaro J., Bakker J.T., Bakker J., van Rood J.J., Oudshoorn M. HLA gene haplotype frequencies in bone marrow donors worldwide registries. Hum. Immunol. 1997; 52(1): 54-7.

Wennerström A., Vlachopoulou E., Lahtela L.E., Paakkanen R., Eronen K.T., Seppänen M., et al. Diversity of extended HLA-DRB1 haplotypes in the Finnish population. PLoS One. 2013; 8(11): e79690.

Johansson A., Ingman M., Mack S.J., Erlich H., Gyllensten U. Genetic origin of the Swedish Sami inferred from HLA class I and class II allele frequencies. Eur. J. Hum. Genet. 2008; 16(11): 1341-9.

Arnaiz-Villena A., Martinez-Laso J., Moscoso J., Livshits G., Zamora J., Gomez-Casado E., et al. HLA genes in the Chuvashian population from European Russia: admixture of Central European and Mediterranean populations. Hum. Biology. 2003; 75(3): 375-92.

Mohyuddin A., Mehdi S.Q. HLA analysis of the Parsi (Zoroastrian) population in Pakistan. Tissue Antigens. 2005; 66(6): 691-5.

Park M.H., Kim H.S., Kang S.J. HLA-A, -B, -DRB1 allele and haplotype frequencies in 510 Koreans. Tissue Antigens. 1999; 53 (4, Pt 1): 386-90.

Li X.F., Zhang X., Chen Y, Zhang K.L., Liu X.J., Li J.P An analysis of HLA-A, -B, and -DRB1 allele and haplotype frequencies of 21,918 residents living in Liaoning, China. PloS One. 2014; 9(4): e93082. doi: 10.1371/journal.pone.0093082.

Kuranov A.B., Vavilov M.N., Abildinova G.Zh., Akilzhanova A.R., Iskakova A.N., Zholdybayeva E.V, et al. Polymorphisms of HLA-DRB1, -DQA1 and -dQb1 in inhabitants of Astana, the capital city of Kazakhstan. PloS One. 2014; 9(12): e115265. doi: 10.1371/journal.pone.0115265.

Schmidt A.H., Solloch U.V, Pingel J., Baier D., Böhme I., Dubicka K., et al. High-resolution human leukocyte antigen allele and haplotype frequencies of the Polish population based on 20,653 stem cell donors. Hum. Immunol. 2011; 72(7): 558-65.

Abi-Rached L., Jobin M.J., Kulkarni S., McWhmnie A., Dalva K., Gragert L., et al. The shaping of modern human immune systems by multiregional admixture with archaic humans. Science. 2011; 334(6052): 89-94. doi: 10.1126/science.1209202.

Fernandez Vina M.A., Hollenbach J.A., Lyke K.E., Sztein M.B., Maiers M., Klitz W., et al. Tracking human migrations by the analysis of the distribution of HLA alleles, lineages and haplotypes in closed and open populations. Phiosl. Trans. R. Soc. Lond. B Biol. Sci. 2012; 367(1590): 820-9. doi: 10.1098/ rstb.2011.0320.