Страница статьи

ВЫЯВЛЕНИЕ ГЕНА БЕЛКА-АДГЕЗИНА BABA2 У КЛИНИЧЕСКИХ ИЗОЛЯТОВ HELICOBACTER PYLORI


DOI: https://doi.org/10.51620/0869-2084-2022-67-9-538-543

Полный текст:


Аннотация

Приведены результаты сравнительного анализа эффективности двух наборов праймеров для детекции и оценки распространённости гена babA2 (контролирует синтез фактора вирулентности функционально-активного белка-адгезина BabА) у 52 клинических изолятов H. pylori, выделенных от пациентов с хроническим гастритом (ХГ, n=32), язвенным поражением двенадцатиперстной кишки (ЯДК, n=16) и раком желудка (РЖ, n=4) в Санкт-Петербурге. Детекция гена babA2 проводилась методом ПЦР с использованием 271 п.н.- и 832 п.н.- наборов праймеров с последующим секвенированием продуктов амплификации. Наибольшая доля babA2-позитивных штаммов - 90,4% (47/52) выявлена с использованием праймеров для детекции продукта амплификации 271 п.н.; детекция ПЦР-продукта 832 п.н. наблюдалась лишь в 51,9% случаев (27/52), статистически значимые различия не установлены (р>0,05). Биоинформационный анализ выявил гомологию секвенированных по Сэнгеру ПЦР-продуктов 271 п.н. и 832 п.н. гена babA2 с участками генов babA2, babA1 и химерного генома (babB/babA1) штаммов H. pylori, аннотированных в базе данных NCBI. Вне зависимости от использованного набора праймеров, связь между выявлением гена babA2 у штаммов H. pylori с принадлежностью пациентов к группам с различными формами заболевания (ХГ, ЯДК, РЖ) статистически не значима (р>0,05). Анализ сочетания трёх генов вирулентности babA2, cagA, vacAs1 не выявил связи babA2+/cagA+/vacAs1+ генотипа штаммов H. pylori с различными клиническими проявлениями H. pylori-инфекции (р>0,05). Ни один из двух наборов праймеров (271 п.н., 832 п.н.) не является достаточно надёжным для детекции гена babA2 с целью оценки вирулентности российских штаммов H. pylori.


Для цитирования: Сварваль А.В., Старкова Д.А., Ферман Р.С. Выявление гена белка-адгезина babА2 у клинических изолятов Helicobacter pylori. Клиническая лабораторная диагностика. 2022; 67(9): 538-543. https://doi.org/10.51620/0869-2084-2022-67-9-538-543

For citation: Svarval A.V., Starkova D.A., Ferman R.S. Detection of the babA2 adhesin protein gene in Helicobacter pylori clinical isolates. Klinicheskaya Laboratornaya Diagnostika (Russian Clinical Laboratory Diagnostics). 2022; 67(9): 538-543 (in Russ.) https://doi.org/10.51620/0869-2084-2022-67-9-538-543

Обратные ссылки

  • Обратные ссылки не определены


Creative Commons License
Контент доступен под лицензией Creative Commons Attribution 3.0 License.

ISSN: (Print)
ISSN: (Online)